為整合本校商學院之跨領域學術研究，進行相關之學術活動，民國 88 年 10 月，在馬君梅教授主持下正式成立「商學研究室」，執行政府與民間委託之研究、建教合作及人才培訓計畫，並舉辦各項研討會及論壇。民國 94 年 2 月，經校務會議通過，商學研究室改制為「商學研究發展中心」，由馬君梅教授擔任首任主任。推動跨系、跨院、跨校之合作，結合研究人力資源，落實跨領域整合之目標，陸續完成許多整合型研究計畫與學術交流會議。
今後仍將積極將擴大研究課題，塑造本校商學院之特色，對內推動跨系所、跨領域的研究活動，對外開展校際合作及國際交流。同時也對商學院的新增學系，提供必要的人力、物力支援，藉以營造全院的學術氣氛，提升教師的研究水平。期望在最短的時程中，有效發揮本校在風險管理研究方面所蘊藏的可觀潛力，將本校的商學院帶入國際，走向世界。
東吳大學商學研究發展中心設有中心主任一人、研究人員與行政人員。目前成立「教學社群」與「研究社群」兩大類專業社群，每個社群均設有召集人一人，結合校內外專家學者依照主題組成專業研究群。
