這次公投綁大選衍生許多亂象，其中公投主文又長又難懂，成為討論焦點之一。學者認為，現行公投案以「你是否同意」開頭，易產生雙重否定問題，未來中選會可提出示範版本或加入法案內容，讓題意更明確。

公投法修正通過後，門檻大降，公投提案暴增，37個全國性公投提案，最後成案合併九合一大選投票的共有10案，投票當天發生許多亂象，不但創下開票最久紀錄，還出現投票時間截止仍大排長龍投票。

根據「公投法」第23條規定，公投案公告後時應於1個月到6個月之間，且該期間若遇到全國性的大選，應一起舉行。這次10案公投，以最晚成案的「以核養綠」為例，10月23日公告成案，11月24日就投票，選民只有一個月時間了解議題，和瑞士公投案從申請到進行投票時間可能長達4年相較，實在過於匆促。

匆忙上陣的結果，加上議題眾多、主文過長，導致許多民眾看不懂，甚至可能投下和自己立場相左的結果。其中主文的敘述，以「你是否同意」開頭，易產生雙重否定問題，讓人一頭霧水，引發網路上掀起照樣造句風潮，凸顯其問題。

東吳大學法律系副教授胡博硯指出，中選會在審查過程中，想讓各提案主文中性呈現，要求不能把理由也寫進主文，這是對的，但一律用「你是否同意」制式開頭，文意上較複雜化，容易產生雙重否定問題。

政治大學法學院副教授廖元豪也說，他也不認為公投主文須以「你是否同意」開頭，以反核食公投來說，前面已有「是否」，後面又有「維持禁止」，文意上變得複雜難懂。

反空污公投這次也通過，但地球公民基金會副執行長王敏玲受訪指出，此公文的主文並未寫清楚，主文寫到要以平均每年至少降1%的方式降低火力發電廠發電量，但火力發電廠是指燃氣還是燃煤，並未清楚載明，若是降燃氣恐導致燃煤增加，空污可能更嚴重。

胡博硯認為，主文問題不一定要修法，中選會可提出範本，提案者須依此模式，若不依循，也明確告知文字會被修改。

廖元豪說，重點不是主文文字要多長，而是提案明確。以挺同或反同公投來說，可明確提出理想的民法或專法的法案是什麼樣子，也讓民眾做決定時了解，投下同意的效果為何。

廖元豪以美國加州今年11月的公投綁大選為例，公投案也有11案，主文更複雜，但這是直接民主要付出的代價，提案者題目必須「講清楚要什麼」，政府也要提供充足資訊，包括提供法律諮詢協助擬法案條文、計算公投成本等，各方面的細節都要注意到。

為使公投主文更簡潔易懂，中選會擬修正公投案主文字數不超過30字為限。除此之外，選民除了投票，也要為自己的選擇負責。世新大學新聞系教授彭懷恩選前受訪時就提出，公投是直接民權的展現，除了由人民表態同意或不同意外，應該是「你懂你才去投」，對議題熟悉、有下功夫，才是深思熟慮的民主。